Cet énorme secteur protégé s'étire du Lac Natron (le nichoir pour les flamants de l'Afrique orientale) dans le nord-est, au Lac Enyasi au sud et le Lac Manyara à l'est. Le secteur inclut Ol-Ndoinyo toujours actif Lengai ou "la Montagne de Dieu" dans Maa, la langue du Masaai, le volcan Olduvai la Gorge et le Cratère Ngorongoro, le plus grand cratère intact dans le monde. Il a été décrit comme un des grands miracles naturels du monde. Il y a huit millions d'années, le Cratère Ngorongoro était un volcan en activité mais son cône s'est effondré, formant le cratère qui est 610 mètres de profondeur, 20 kilomètres dans le diamètre et couvre un secteur de 311 km carré. Spectaculaire comme il est, le cratère occupe juste un dixième du Secteur protégé Ngorongoro.